Aptamères et anticorps
Quelles sont les différences et les avantages ?

Les aptamères et les anticorps jouent un rôle central dans les diagnostics et les analyses. Leurs spécificités de liaison élevées en font des outils de choix pour la détection quantitative de cibles moléculaires dans divers échantillons (tissus, sang, eau, aliments,...). Ils sont largement utilisés pour la biodétection en association avec différentes modalités de transduction du signal (fluorescence, colorimétrie, électrochimie). Ils permettent la détection quantitative spécifique de la molécule cible sur le terrain grâce à des tests simples, bon marché et rapides.

Les aptamères et les anticorps jouent un rôle central dans la recherche biomédicale et la pratique médicale. Leurs spécificités de liaison élevées en font des outils de choix pour la détection et l'identification de cibles moléculaires spécifiques dans les échantillons biologiques. Ils sont largement utilisés dans les tests de diagnostic, la découverte de biomarqueurs, la caractérisation des protéines et la compréhension des mécanismes sous-jacents aux maladies. En médecine, les anticorps monoclonaux sont utilisés pour traiter certaines maladies autoimmunes et certains types de cancer. Les aptamères, quant à eux, offrent une alternative prometteuse, notamment en tant que vecteurs de médicaments ciblés et de médecine personnalisée.

Le processus de sélection des aptamères, ou SELEX, est au cœur de l'identification des aptamères spécifiques. Il commence par la synthèse d'une bibliothèque aléatoire d'oligonucléotides dans laquelle chaque séquence possède une structure tridimensionnelle unique.

Mécanisme de liaison spécifique

Les aptamères forment des liaisons hydrogène, des interactions électrostatiques et des interactions de Van der Waals avec la cible. Cela permet une liaison hautement spécifique entre l'aptamère et sa cible, en fonction des caractéristiques moléculaires précises de cette dernière. La conformation tridimensionnelle de l'aptamère est cruciale, lui permettant de s'adapter parfaitement à la forme de la cible, assurant ainsi la spécificité de la liaison.

Applications dans la recherche et la médecine

La capacité des aptamères à se lier spécifiquement à des cibles moléculaires en fait des outils précieux pour
la détection de biomarqueurs, la caractérisation des protéines, l'analyse des médicaments et
des contaminants et la compréhension des mécanismes biologiques.
Ils sont également utilisés pour cibler spécifiquement les cellules tumorales ou les cellules infectées par un virus, ce qui ouvre la voie
à des possibilités de traitement ciblé. Dans le domaine de la recherche, les aptamères sont utilisés pour étudier les interactions
entre protéines, identifier les partenaires de liaison et explorer les réseaux de signalisation cellulaire.

L'un des principaux avantages des aptamères par rapport aux anticorps est leur grande spécificité. Les aptamères sont identifiés en laboratoire par des criblages positifs et négatifs afin de distinguer des cibles similaires.
Le processus de sélection SELEX génère des aptamères qui se lient étroitement et spécifiquement à la cible, en minimisant la liaison non spécifique à d'autres molécules dans l'échantillon.
Cette spécificité garantit une plus grande précision dans la détection et la quantification des cibles moléculaires et réduit le risque de faux positifs et de faux négatifs.
Polyvalence des aptamères : Les aptamères sont obtenus par synthèse chimique sur support solide. Des modifications chimiques peuvent être introduites à volonté sur des sites donnés afin de leur conférer des propriétés supplémentaires en fonction de l'application (augmentation de la durée de vie, détection par fluorescence, immobilisation sur une biopuce, ...).
Stabilité thermique des aptamères : Chauffer une solution d'aptamères à 80-90 °C les dénature. Cependant, contrairement aux protéines, ils se replient lors du refroidissement et retrouvent leur fonctionnalité.

Avantage des aptamères en termes de coûts

La production à grande échelle d'anticorps monoclonaux nécessite le développement et l'entretien de lignées cellulaires hybrides, ce qui est extrêmement coûteux. De plus, la production d'anticorps nécessite des installations spécialisées et donc un investissement important en ressources matérielles.

En revanche, en termes de coûts de production, les aptamères présentent un avantage significatif par rapport aux anticorps. De plus, la synthèse chimique des aptamères, y compris dans des conditions BPF, garantit un approvisionnement sans variabilité de lot.

Notre partenariat avec Eurogentec

Eurogentec fournit des produits et des services d'oligonucléotides aux scientifiques impliqués dans la recherche en sciences de la vie, le diagnostic moléculaire et le développement thérapeutique. Expert en synthèse à petite et grande échelle, Eurogentec produit une large gamme d'oligonucléotides, y compris des oligonucléotides modifiés chimiquement (squelettes résistants aux nucléases, bases nucléiques modifiées, séquences conjuguées à une extrémité, etc…). Novaptech et Eurogentec ont signé un accord de partenariat pour la production d'aptamères sélectionnés par Novaptech. https://www.eurogentec.com/en/search?q=novaptech

Faible/absence d'immunogénicité des aptamères

Un autre avantage majeur dans le match anticorps vs aptamère réside dans la faible voire l'absence d'immunogénicité des aptamères par rapport aux anticorps.