Sélection et caractérisation d’aptamères à la demande
Développement d'aptamères personnalisés
Novaptech sélectionne des aptamères contre tout type de cible: petites molécules naturelles ou synthétiques, peptides, protéines, virus et bactéries non pathogènes, cellules eucaryotes. Nous utilisons des banques de séquences optimisées, conçues avec une fenêtre aléatoire de taille variable pour répondre aux besoins spécifiques des clients.
Les aptamères sélectionnés, qu’ils soient ADN, ARN ou ARN chimiquement modifiés, sont caractérisés en fonction de leurs propriétés de liaison et de leur spécificité d’interaction avec la cible, grâce à des techniques telles que la résonance plasmonique de surface (SPR), l’interférométrie en bio-couche (BLI) ou l’émission de fluorescence.
Nous optimisons ces aptamères pour une synthèse simple, rentable et des propriétés améliorées. Nous fournissons des échantillons des aptamères sélectionnés et caractérisés grâce à notre partenariat avec Eurogentec. Plusieurs types d'aptamères chimiquement modifiés peuvent être fournis en petites ou grandes quantités, dans des conditions GMP si nécessaire.
Notre processus de sélection est divisé en phases successives et indépendantes. Un rapport scientifique est fourni après chaque phase qui se termine par un « Go/noGo ».
0 - Etude de faisabilité
Discussion détaillée avec un scientifique senior de Novaptech pour définir la procédure et les conditions par rapport à l'objectif du client.
1 - Sélection initiale
Des étapes itératives de sélection et d'amplification sur plusieurs cycles, avec des conditions de plus en plus stringentes, sont réalisées. Plusieurs sélections peuvent être effectuées en parallèle. Une contre sélection (négative) peut être introduite.
2 - Sélection d'aptamères polyclonaux
Des cycles supplémentaires de sélection sont réalisés à partir du dernier pool de la phase 1. Les pools sont analysés par séquençage massif de nouvelle génération (NGS). Les candidats d'intérêt sont identifiés par bioinformatique (homologie des séquences, évolution d'un cycle à l'autre, prédiction de la structure secondaire).
3 - Caractérisation des aptamères monoclonaux
Quelques candidats représentatifs identifiés lors de la phase 2 sont synthétisés et évalués en termes d'affinité et de spécificité d'interaction avec la cible. La séquence du ou des meilleurs aptamères est fournie.
4 - Optimisation de l'aptamère sélectionné
Les aptamères sélectionnés peuvent être optimisés en fonction du type d'analyse dans lequel ils seront utilisés. L'aptamère brut sélectionné peut être découpé pour éliminer les parties non nécessaires à la liaison. L'aptamère tronqué résultant peut ensuite être chimiquement modifié ou conjugué à divers groupes en attente pour le rendre résistant aux nucléases ou pour une détection par fluorescence, par exemple. D'autres modifications peuvent être introduites et testées.
5 - Synthèse d'aptamères
Novaptech fournit une petite quantité de l’aptamère sélectionné au client pour les premiers essais. Des quantités plus importantes d’aptamères avec de nombreuses modifications chimiques peuvent être obtenues auprès de notre partenaire. Eurogentec.
Avec Novaptech vous bénéficiez de presque 30 ans d'expérience sur les aptamères. Dès le début de votre projet, vous avez un contact personnel avec l'un de nos scientifiques seniors pour évaluer la faisabilité, concevoir la bibliothèque et la procédure de sélection, définir les modifications chimiques et le test. Un feedback est fourni à chaque étape de votre projet.
Nos chercheurs en R&D développent des procédés innovants pour la sélection des aptamères et la conception d'essais, immédiatement proposés à nos clients. Chez Novaptech, nos activités se concentrent sur une classe particulière d'aptamères «aptaswitch», exploitant la technologie unique NOVAswitch.
Novaptech a obtenu l'agrément Crédit Impôt Recherche (CIR) depuis 2020, jusqu’à 2027. Les clients de Novaptech peuvent bénéficier d'un crédit d'impôt remboursable pour les services de R&D confiés à Novaptech. Vous pouvez consulter la certification ici.
Eurogentec est un acteur clé dans la fourniture de produits et services destinés aux chercheurs en sciences de la vie, au diagnostic moléculaire et au développement thérapeutique. Fort d’une expertise en synthèse d’oligonucléotides à petite et grande échelle, Eurogentec propose une large gamme de séquences personnalisées, allant des amorces classiques de PCR aux molécules plus complexes, éventuellement chimiquement modifiées.
Dans le cadre de son expertise en sélection d’aptamères, Novaptech a établi un partenariat stratégique avec Eurogentec afin de garantir une production fiable et de haute qualité des aptamères sélectionnés par ses équipes.
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