Aptamères à commutation de structure

Aptaswich

Les aptamères changent généralement de conformation lors de leur liaison à leur ligand. Ce phénomène peut être exploité à la fois pour leur sélection et pour signaler la présence de la cible. Le changement structurel est alors associé à un signal (comme le transfert d'énergie de fluorescence, par exemple). Cette propriété peut être intentionnellement utilisée pour la conception de biocapteurs à base d’aptamères.

Technologie NOVAswitch

La sélection est réalisée contre des molécules libres en solution, tandis que la banque d'oligonucléotides est immobilisée sur un support. Les candidats libérés dans la solution après l'ajout de la molécule cible sont collectés, amplifiés et analysés. Dans un autre format, la sélection tire parti des interactions dites de "kissing". Dans ce cas, l'ajout de la cible favorise l'interaction des candidats avec un oligonucléotide en épingle à cheveux, qui sont ensuite collectés, amplifiés et analysés. Les candidats sélectionnés sont des aptaswitch fonctionnels. Ils peuvent être intégrés dans des biosenseurs avec différentes modalités de transduction du signal.

Exemples d'applications

Durand, G., Lisi, S., Ravelet, C., Dausse, E., Peyrin, E., & Toulmé, J.-J. (2014). Riboswitches Based on Kissing Complexes for the Detection of Small Ligands. Angewandte Chemie International Edition, 53(24), 6105–6110.

Durand, G., Dausse, E., Goux, E., Fiore, E., Peyrin, E., Ravelet, C., & Toulmé, J.-J. (2016). A combinatorial approach to the repertoire of RNA kissing motifs; towards multiplex detection by switching hairpin aptamers. Nucleic Acids Research, 44(9), 4450-4459.

Goux, E., Dausse, E., Guieu, V., Azéma, L., Durand, G., Henry, M., Choisnard, L., Toulmé, J.-J., Raveleta, C., & Peyrin, E. (2017). A colorimetric nanosensor based on a selective target-responsive aptamer kissing complex. Nanoscale, Issue 12.

Tests basés sur les aptaswitch

Tests rapides

Tests bandelette

Suivi pour la sécurité alimentaire et l’environnement

Détection d'un médicament dans des fluides biologiques

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