La méthode SELEX, le processus de sélection utilisé par Novaptech pour l'identification d'aptamères

La sélection d'aptamères est un procédé biotechnologique que nous utilisons pour identifier des oligonucléotides (ADN ou ARN) qui se lient spécifiquement à une cible donnée. Cette méthode SELEX, qui signifie Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment, implique plusieurs cycles de liaison de l'aptamère à la cible, suivis de la séparation des complexes formés, de l'amplification des aptamères liés et de leur réintroduction dans le cycle de sélection suivant. Ce processus enrichit progressivement la population d'aptamères en molécules ayant une forte affinité pour la cible visée. En fin de compte, cela permet d'isoler des aptamères ayant des propriétés de liaison optimales pour des applications diagnostiques, thérapeutiques, analytiques ou de recherche.

Apprenez-en davantage sur les Aptamères et leurs avantages dans la comparaison des Aptamères par rapport aux anticorps. Plongez dans les spécificités de l’analyse des biomarqueurs et découvrez les recherches de pointe de notre laboratoire de biotechnologie, ainsi que les techniques innovantes de découverte des biomarqueurs.

Que sont les aptamères ?

À propos des aptamères d'acide nucléique et de la sélection in vitro

Aptamer SELEX

Aptamères : une définition

Les aptamères sont des acides nucléiques simple brin (ADN ou ARN) qui se replient en structures complexes. Ils sont capables de se lier avec une grande affinité et spécificité à une cible prédéterminée. Ils peuvent être définis comme des « anticorps artificiels ». Les aptamères sont sélectionnés à partir d'une bibliothèque d'oligonucléotides synthétisée de manière aléatoire contenant environ 1 015 séquences différentes par un processus de sélection in vitro itératif alternant des étapes de liaison et d'amplification.

Le processus de sélection in vitro

La sélection des aptamères est réalisée en mélangeant la cible avec la bibliothèque. La partition entre séquences cibles et séquences libres est réalisée par différentes méthodes : filtration, chromatographie, centrifugation. Les oligonucléotides liés à la cible sont amplifiés par PCR et le pool résultant est mélangé à la cible sous une pression de sélection accrue. La procédure est répétée plusieurs fois. Parmi des millions de séquences, les liants les plus forts « survivront » à l’évolution dirigée. Les aptamères sont identifiés après séquençage.

Applications d'aptamères

APTAMÈRES COMME THÉRAPEUTIQUE

APTAMÈRES POUR LE DIAGNOSTIC EN SANTÉ HUMAINE ET ANIMALE

APTAMÈRES À DES FINS ANALYTIQUES, SURVEILLANCE DE L'ENVIRONNEMENT ET DE LA SÉCURITÉ ALIMENTAIRE

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Biomarker analysis

Votre contact scientifique :

Jean-Jacques Toulmé, PhD, CSO

SELEX est une technique de pointe utilisée pour identifier, à partir d'une vaste bibliothèque de séquences d'oligonucléotides, celles qui ont la capacité de se lier spécifiquement et fortement à une cible donnée, qu'il s'agisse d'une petite molécule, d'une protéine ou même de cellules intactes. Ce processus, maîtrisé par les experts de Novaptech, exploite la diversité moléculaire pour isoler des aptamères présentant une grande affinité et spécificité pour leur cible.

L'approche SELEX de sélection des aptamères est une méthode très complexe qui débute par la synthèse d'une bibliothèque d'oligonucléotides présentant une grande diversité, indispensable pour identifier des séquences ayant une affinité spécifique pour une cible donnée. À travers une série d'étapes successives : liaison, séparation et amplification, ce processus affine et enrichit cette bibliothèque en aptamères hautement spécifiques. Cette approche systématique garantit une sélection efficace et précise, ouvrant la voie à des applications innovantes dans divers domaines de la recherche et de la thérapeutique.

 
1. Création d'une bibliothèque : la méthode SELEX commence par la création d'une bibliothèque contenant une grande variété de séquences d'oligonucléotides. Cette diversité est essentielle pour une sélection réussie, car elle offre un large spectre de candidats aptamères potentiels.

 
2. Liaison avec la cible : les séquences sont mises en contact avec la cible d'intérêt. Seules celles qui se lient à la cible sont conservées pour les étapes suivantes, tandis que celles qui ne se lient pas sont éliminées.

 
3. Séparation et récupération : les complexes aptamère-cible sont séparés des séquences non liantes. Cette étape fait appel à diverses méthodes de séparation telles que la filtration, l'utilisation de colonnes d'affinité ou la centrifugation.

 
4. Amplification : les aptamères liés sont ensuite amplifiés, soit par PCR pour l'ADN, soit par transcription inverse suivie de PCR pour l'ARN, afin de générer la bibliothèque enrichie pour un cycle de sélection supplémentaire

 
Enrichissement ciblé : le processus de liaison, de séparation et d'amplification est répété sur plusieurs cycles afin d'enrichir progressivement la bibliothèque avec les séquences ayant la plus grande affinité pour la cible.

Le principe de sélection SELEX a révolutionné le développement d'outils pour une multitude d'applications, allant du diagnostic médical et de la détection environnementale au ciblage thérapeutique.

Les aptamères sélectionnés par SELEX par Novaptech offrent plusieurs avantages par rapport aux anticorps traditionnels, notamment une plus grande stabilité, une synthèse moins coûteuse et l'absence de variabilité d'un lot à l'autre.

Applications :

Diagnostic médical : utilisé pour la détection précoce de maladies grâce à l'identification de biomarqueurs spécifiques.

Thérapeutique : permet le développement de nouveaux médicaments et/ou le ciblage de cellules malades sans affecter les cellules saines

Analyse environnementale : détecte spécifiquement les contaminants ou les toxines dans l'eau, l'air et le sol.

En fait, toute application impliquant des anticorps peut être traduite en aptamères et en bénéficier.

Avantages par rapport aux anticorps :

Plus grande stabilité : les aptamères sont plus résistants aux variations de température et de pH.

Synthèse rentable : les aptamères sont moins coûteux à produire.

Reproductibilité : les aptamères minimisent les variations d'un lot à l'autre, ce qui garantit une qualité constante.

Flexibilité de modification : les aptamères peuvent être facilement modifiés pour améliorer la liaison ou la stabilité.

Non-immunogénicité : les aptamères sont moins susceptibles de déclencher des réponses immunitaires indésirables.

Le processus SELEX se distingue des autres méthodes de sélection de ligands, telles que l'immunosélection ou les cribles chimiques, principalement en raison de sa grande spécificité, de sa rapidité et de son faible coût.
Contrairement à l'immunosélection, qui repose sur la production longue et coûteuse d'anticorps, le principe SELEX permet une sélection rapide et efficace d'aptamères, en fonction de la nature des oligonucléotides, sans avoir recours à des systèmes biologiques vivants (cellules ou animaux).
Quant au criblage chimique, bien que large dans son approche, il ne garantit pas la haute spécificité atteinte par SELEX.
SELEX offre une méthode plus ciblée et plus rentable d'identifier des molécules ayant une affinité précise pour leur cible, ce qui rend cette technique particulièrement attrayante pour le développement de kits et de dispositifs de test rapides.

Les innovations dans le domaine de SELEX, menées par Novaptech, telles que l'intégration de technologies à haut débit, ont transformé la sélection d'aptamères, rendant le processus plus rapide et plus précis.
Notre principe de sélection d'aptamères SELEX à haut débit utilise des techniques de séquençage et de criblage massifs pour analyser des millions de séquences simultanément.
En ce qui concerne les perspectives d'avenir, l'évolution continue de SELEX, combinée à l'expertise de Novaptech, promet d'ouvrir de nouvelles voies dans la recherche et le développement de traitements innovants. Grâce aux avancées technologiques et aux recherches menées par Novaptech, le processus SELEX continue d'évoluer, intégrant des méthodes à haut débit et des analyses computationnelles pour accélérer la sélection et l'identification des aptamères. Ces innovations promettent d'élargir encore l'application des aptamères dans la recherche.
La capacité de la méthode SELEX à isoler des molécules hautement spécifiques en fait un pilier essentiel dans le domaine de la biotechnologie. Avec cette application à la sélection d'aptamères, Novaptech ouvre la voie à des découvertes qui transformeront notre approche de la détection et du traitement des maladies.

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