Aptamère est une approche biotechnologique permettant d’identifier des oligonucléotides (ADN ou ARN ou ARN modifié chimiquement) capables de se lier spécifiquement à une cible donnée.
La méthode SELEX (Systematic Evolution of Ligands by EXponential Enrichment) repose sur une série de cycles successifs : les aptamères sont mis en contact avec leur cible, les complexes formés sont isolés, les aptamères liés sont amplifiés, puis réintroduits dans le cycle suivant.
Différentes stratégies SELEX sont utilisées par Novaptech pour identifier des aptamères ciblant des petites molécules, des macromolécules ou des cellules.
Ce processus itératif enrichit progressivement la population en aptamères présentant une affinité et une spécificité élevées pour la cible sélectionnée.
Cette méthode permet d’isoler des aptamères aux propriétés de liaison optimales, adaptés à diverses applications, notamment dans les domaines diagnostique, thérapeutique, analytique ou de recherche.
Découvrez-en plus sur les aptamères et leur avantages en comparant Aptamères et anticorpsExplorez les spécificités de l' analyse des biomarqueurs et découvrez les recherches de pointe menées dans notre laboratoire de biotechnologieainsi que les techniques innovantes d’analyse des biomarqueurs .
Les aptamères sont des acides nucléiques simple brin (ADN ou ARN, éventuellement chimiquement modifiés) capables de se replier en structures tridimensionnelles complexes. Ces structures leur permettent de se lier avec une grande affinité et spécificité à une cible donnée. Par analogie, ils sont parfois décrits comme des « anticorps synthétiques ». La sélection des aptamères se fait à partir d’une bibliothèque d’oligonucléotides synthétiques, générée aléatoirement et contenant environ 1015 séquences différentes. Ce processus repose sur une méthode in vitro itérative combinant des étapes de liaison à la cible et d’amplification.
La sélection des aptamères repose sur un processus où la cible est mise en contact avec une bibliothèque d’oligonucléotides. Novaptech utilise plusieurs bibliothèques, développées en interne, qui sont adaptées à la cible et à l’application finale des aptamères.
La récupération des séquences liées à la cible et des séquences non liées, appelée partition, est réalisée par différentes méthodes telles que la filtration, la chromatographie ou la centrifugation. Les oligonucléotides liés à la cible sont ensuite amplifiés par PCR, et le pool résultant est de nouveau mis en contact avec la cible sous une pression de sélection accrue.
Ce cycle est répété plusieurs fois. Parmi des millions de séquences, seules les plus fortes affinités pour la cible « survivent » à cette évolution dirigée.
Les aptamères ainsi sélectionnés sont identifiés par séquençage à haut débit suivi d’une analyse bioinformatique, utilisant des algorithmes développés spécifiquement par Novaptech.
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Votre contact scientifique :
Jean-Jacques Toulmé, PhD, CSO
SELEX est une technique de pointe utilisée pour identifier, à partir d'une vaste bibliothèque de séquences d'oligonucléotides, celles qui ont la capacité de se lier spécifiquement et fortement à une cible donnée, qu'il s'agisse d'une petite molécule, d'une protéine ou même de cellules intactes. Ce processus, maîtrisé par les experts de Novaptech, exploite la diversité moléculaire pour isoler des aptamères présentant une grande affinité et spécificité pour leur cible.
L'approche SELEX de sélection des aptamères est une méthode très complexe qui débute par la synthèse d'une bibliothèque d'oligonucléotides présentant une grande diversité, indispensable pour identifier des séquences ayant une affinité spécifique pour une cible donnée. À travers une série d'étapes successives : liaison, séparation et amplification, ce processus affine et enrichit cette bibliothèque en aptamères hautement spécifiques. Cette approche systématique garantit une sélection efficace et précise, ouvrant la voie à des applications innovantes dans divers domaines de la recherche et de la thérapeutique.
1. Création d'une bibliothèque : la méthode SELEX commence par la création d'une bibliothèque contenant une grande variété de séquences d'oligonucléotides. Cette diversité est essentielle pour une sélection réussie, car elle offre un large spectre de candidats aptamères potentiels.
2. Liaison avec la cible : les séquences sont mises en contact avec la cible d'intérêt. Seules celles qui se lient à la cible sont conservées pour les étapes suivantes, tandis que celles qui ne se lient pas sont éliminées.
3. Séparation et récupération : Les complexes aptamère-cible sont séparés des séquences non liées. Cette étape implique diverses méthodes de séparation, telles que la filtration, l'utilisation de colonnes/billes d'affinité ou la centrifugation.
4. Amplification : les aptamères liés sont ensuite amplifiés, soit par PCR pour l'ADN, soit par transcription inverse suivie de PCR pour l'ARN, afin de générer la bibliothèque enrichie pour un cycle de sélection supplémentaire.
5. Enrichissement ciblé : le processus de liaison, de séparation et d'amplification est répété sur plusieurs cycles afin d'enrichir progressivement la bibliothèque avec les séquences ayant la plus grande affinité pour la cible.
Le principe de sélection SELEX a révolutionné le développement d'outils pour une multitude d'applications, allant du diagnostic médical et de la détection environnementale au ciblage thérapeutique.
Les aptamères sélectionnés par SELEX par Novaptech offrent plusieurs avantages par rapport aux anticorps traditionnels, notamment une plus grande stabilité, une synthèse moins coûteuse et l'absence de variabilité d'un lot à l'autre.
Applications :
· Diagnostic médical : utilisé pour la détection précoce de maladies grâce à l'identification de biomarqueurs spécifiques.
· Thérapeutique : permet le développement de nouveaux médicaments et/ou le ciblage de cellules malades sans affecter les cellules saines.
· Analyse environnementale : Détecte spécifiquement les contaminants (molécules ou organismes microbiens) dans l'eau, l'air et le sol.
En fait, toute application impliquant des anticorps peut être traduite en aptamères et en bénéficier.
Avantages par rapport aux anticorps :
· Plus grande stabilité : les aptamères sont plus résistants aux variations de température et de pH.
· Synthèse rentable : les aptamères sont moins coûteux à produire.
· Reproductibilité : Les aptamères éliminent les variations entre les lots, garantissant une qualité constante.
· Flexibilité de modification : les aptamères peuvent être facilement modifiés pour améliorer la liaison ou la stabilité.
· Non-immunogène: les aptamères sont moins susceptibles de déclencher des réponses immunitaires indésirables.
Le processus SELEX se distingue des autres méthodes de sélection de ligands, telles que
l'immunosélection ou les cribles chimiques, principalement en raison de sa grande spécificité,
de sa rapidité et de son faible coût.
Contrairement à l'immunosélection, qui repose sur la production longue et coûteuse d'anticorps,
le principe SELEX permet une sélection rapide et efficace d'aptamères, en fonction de la nature
des oligonucléotides, sans avoir recours à des systèmes biologiques vivants (cellules ou
animaux).
Quant au criblage chimique, bien que large dans son approche, il ne garantit pas la haute
spécificité atteinte par SELEX.
SELEX offre une méthode plus ciblée et plus rentable d'identifier des molécules ayant une
affinité précise pour leur cible, ce qui rend cette technique particulièrement attrayante pour le
développement de kits et de dispositifs de test rapides.
Les innovations dans le domaine de SELEX, menées par Novaptech, telles que l'intégration de
technologies à haut débit, ont transformé la sélection d'aptamères, rendant le processus plus
rapide et plus précis.
Notre principe de sélection d'aptamères SELEX à haut débit utilise des techniques de
séquençage et de criblage massifs pour analyser des millions de séquences simultanément.
En ce qui concerne les perspectives d'avenir, l'évolution continue de SELEX, combinée à
l'expertise de Novaptech, promet d'ouvrir de nouvelles voies dans la recherche et le
développement de traitements innovants.
Grâce aux avancées technologiques et aux recherches menées par Novaptech, le processus
SELEX continue d'évoluer, intégrant des méthodes à haut débit et des analyses
computationnelles pour accélérer la sélection et l'identification des aptamères. Ces innovations
promettent d'élargir encore l'application des aptamères dans la recherche.
La capacité de la méthode SELEX à isoler des molécules hautement spécifiques en fait un pilier
essentiel dans le domaine de la biotechnologie. Avec cette application à la sélection
d'aptamères, Novaptech ouvre la voie à des découvertes qui transformeront notre approche de
la détection et du traitement des maladies.
2 avenue Favard
Entrée 5, 1er étage
33170 GRADIGNAN, FRANCE
contact@novaptech-com
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